中科院上海有机化学研究所好。中科院上海有机化学研究所和清华大学化学系都是国内知名的化学研究机构，它们在不同方面都有较高的学术水平和研究实力。中科院上海有机化学研究所是以有机化学为主要研究方向，其研究领域涉及药物化学、材料化学、天然产物化学等。而清华大学化学系则是综合性的化学研究机构，其研究领域包括有机化学、无机化学、分析化学、物理化学等。两个机构都在学术研究和科研成果方面取得了较为显著的成绩。中科院上海有机化学研究所在化学合成和药物研究领域有着广泛的应用和重要的贡献；清华大学化学系的科研成果也非常突出，例如在光催化、催化剂设计等领域取得了重要进展。