1、编制注销申请报告：慈善超市应当编制注销申请报告，包括注销原因、注销时间、财产清查情况等，并由法定代表人签字确认。2、向当地慈善组织管理机构申请注销：将编制好的注销申请报告，一并提交到当地慈善组织管理机构，填写注销申请表并提供相关证明材料。3、进行财产清查：在注销申请报告中，应当详细记录慈善超市的财产情况，包括存货、财产捐赠等信息，进行财产清查并制定清查报告。4、完成税务注销：在提交注销申请后，需要完成税务注销手续，包括办理税务注销证明、缴纳税款等。5、进行结余资金处理：在财产清查后，如果存在结余资金，需要按照相关规定进行处理，一般是将剩余资金捐赠给其他慈善组织。