凭祥海关和友谊关海关的区别主要有以下几点。1、地理位置不同：凭祥位于广西壮族自治区凭祥市，是中国国家级海关，友谊关位于江西省萍乡市，是中国省级海关。2、职责范围不同：凭祥海关负责全国范围内的出入境货物检验检疫、关税征收、通关监管等工作，友谊关海关只负责江西省的货物检验检疫、关税征收、通关监管等工作。3、审批权限不同：凭祥海关有权审批全国范围内的出入境货物，而友谊关海关只有权审批江西省的出入境货物。4、管理机构不同：凭祥海关由国家税务总局管理，友谊关海关由江西省税务局管理。口岸是由国家指定对外往来的门户，是国际货物运输的枢纽，海关是国家行政机关。