大树蛙蝌蚪变态期天敌主要是鸟类、蛇类和鼠类，变态期内要经常看管，驱赶麻雀、白头鹎、乌鸫等，严防其啄食蝌蚪。同时，黑眉锦蛇、滑鼠蛇等蛇类最爱捕食蝌蚪，养殖区周边要用围墙及铁丝网防鼠防蛇，上面用铁丝网防鸟。变态后成蛙躲避天敌能力有所增强，且大树蛙的保护色与栖息环境相似，利于隐蔽。幼蛙到成蛙养殖中会出现红腿病、胃肠炎等疾病，要及时防治。红腿病症状是精神不振，低头伏地，不进食，后肢内侧腹下皮肤出现血点，形成红色部分，指端溃烂，腹部、腿部肌肉会发生条状或点状出血斑。发病主要原因是养殖密度过大，环境不卫生，导致病毒侵入引发。预防方法是定期对场地进行消毒。每日使用兽用红霉素、庆大霉素淋浴1次，或在饵料中拌加红霉素。