新民主主义革命与旧民主主义革命的根本区别在于，A、新思想的指导，B、新的政党指导，C、领导阶级不同，D、新的革命纲领。正确答案选C、领导阶级不同，解析：A：新思想的指导是两者的主要区别，不是根本区别，排除A。B：新的政党领导是两者的主要区别，不是根本区别，排除B。C：新民主主义革命是由无产阶级领导的，人民大众的，反对帝国主义、封建主义和官僚资本主义的革命。所谓“新”是相对于由资产阶级领导的反对帝国主义、封建主义以建立资产阶级民主政权的旧民主主义革命而言，新民主主义革命与旧民主主义革命的根本区别是领导阶级的不同，C符合题意。D：新的革命纲领是两者的主要区别，不是根本区别，排除D。故本题选C。