哈茨木霉菌对人体通常没有危害，人在食用哈茨木霉菌喷洒过的水果以及蔬菜后，通常不会出现不良反应。哈茨木霉菌是一种有益的微生物，通常作为农药喷洒在植物上，对植物有一定的益处。哈茨木霉菌可分泌酶以及抗生素类物质，分解病原微生物的细胞壁，还可以在植物根系周围生长，并形成保护罩，以防止根部病原真菌的侵染。同时哈茨木霉菌可以刺激性绿色植物代谢，抵御细菌的生物菌，能够进一步提高植物的抵抗病菌能力。所以哈茨木霉菌常用于治疗镰刀菌、腐霉菌，以及立枯丝核菌等引起的植物病害。