1.指数跟踪的对象不同。科创板50ETF跟踪的是上证科创板50指数，而科创50ETF跟踪的是上证科创板50指数。2.在基本概念上，两者略有不同。科创板50ETF是指成分股为科创板50指数的ETF，科创50ETF则是指成分股为科创板50成分股的ETF。3.在发行规模上也有所不同。科创板50ETF计划募资不超过300亿元人民币，而科创50ETF募资规模较小，计划募集资金不超过20亿元人民币。4.在运作模式上也有所不同。科创板50ETF实行全场交易，即在交易所全天开放时间持续交易；而科创50ETF则属于场内交易品种，只能在交易所上市期间交易。