项目联合申报单位负责人排名应按照项目的实际贡献和责任进行排序，一般情况下，项目牵头单位的负责人排名第一，其他参与单位的负责人按照研究内容、考核指标和经费分配等情况进行排序。项目联合申报单位负责人排名应在项目预申报书和正式申报书中明确填写，并在联合申报协议书中进行确认。联合申报协议书是项目申报的重要附件之一，应由所有参与单位盖章，项目和课题负责人签字，并明确协议签署时间。项目联合申报单位负责人排名一旦确定，原则上不能更改。如确有特殊情况需要调整，应及时向专业机构说明理由，并征得所有参与单位和负责人的同意，重新签订联合申报协议书，并按照专业机构的要求提交相关材料。