1、制作工艺。柑橘蜜是蜜蜂采集柑橘花酿制而成，而蜂巢蜜使蜂蜜筑巢后，蜜蜂在蜂巢内将蜂蜜酿制成熟并封上蜡盖形成蜜脾，未经人为加工，不易掺杂做假和污染可以直接食用的蜂蜜产品，蜂巢蜜营养成分更高，所以蜂巢蜜好。2、功能。柑橘蜜在加工时温度不当使得蜂蜜中最主要的活性物质酶类被灭活或蜂蜜存放时间过长，酶类物质活性降低，而蜂巢蜜含有丰富的生物酶、维生素、多种微量元素、蜂胶、蜂蜡、蛋白质、游离氨基酸、游离脂肪酸和核酸类等化合物为蜜中之极品，加之含有粉花粉，具有极高的人体保健价值，所以蜂巢蜜好。