即便综合工时制已经通过劳动局的批准，用人单位想要从标准工时制调整到综合工时制，也必须经过与员工的协商。这种变更被视为劳动合同的重要修改，需要双方达成一致意见。若劳动者不同意这种变更，用人单位不能单方面进行调整。在这种情况下，劳动者有权拒绝这种变更。如果用人单位试图强制执行，劳动者可以寻求劳动仲裁或法律途径保护自己的权益。此外，劳动者还可以通过与用人单位进行沟通，了解新的工时安排是否合理，是否会影响自己的工作生活平衡。值得注意的是，综合工时制的实施可能会对员工的工作时间、休息时间和工资计算产生影响。因此，劳动者在决定是否接受这种变更时，需要充分考虑这些因素，并确保自己的权益得到充分保障。