合轴分枝是一种较为复杂的分枝方式。此类树木的顶芽在一定时期后会死亡或生长缓慢，或分化成花芽，由位于顶芽下方的侧芽萌发成强壮的延长枝，连接在主轴上继续向上生长，以后此侧枝的顶芽又自剪，由它下方的侧芽代之，逐渐形成了弯曲的主轴。合轴分枝易形成开张式的树冠，通风透光性好，花芽、腋芽发育良好。被子植物中，碧桃、杏、李、苹果、月季、榆、核桃等都属于这种分枝方式。合轴分枝树木放任自然生长时，往往在顶梢上部有几个势力相近的侧枝同时生长，形成多叉树干，不美观。可采用摘除顶端优势的方法或将一年生的顶枝短截，剪口留壮芽，同时疏去剪口下3～4个侧枝；而花果类树干，应扩大树冠，增加花果枝数目，促使树冠内外开花结果。幼树时，应培养中心主枝，合理选择和安排各侧枝，达到骨干枝明显，花果满膛的目的。