在这样一个动荡不安的历史背景下，中国的文化也经历了巨大的变革。玄学的兴起，为儒家思想注入了新的血液；佛教的传入，更是为中国的宗教文化增添了新的色彩；与此同时，道教也在这一时期迎来了勃兴。而波斯、希腊等外来文化的羼入，更是使得这一时期的文化发展更加多元化。在长达三百六十余年的时间里，三十余个大小王朝交替兴灭。这些新的文化因素在这一时期相互碰撞、相互渗透，使得儒学的发展及孔子的形象和历史地位等问题也趋于复杂化。儒家思想，这一曾经辉煌一时的学说，在魏晋南北朝时期经历了新的考验和洗礼，逐渐演变出了具有时代特色的新面貌。