在1959年至1962年间，屠呦呦参加了卫生部全国第三期西医离职学习中医班，系统地学习了中医药知识。她深入药材公司，向老药工学习中药鉴别及炮制技术，并参与北京市的炮制经验总结，从而对药材的品种真伪和道地质量，以及炮制技术有了更深入的理解。经过三年多的科研攻坚，屠呦呦团队在“抗疟机理研究”、“抗药性成因”和“调整治疗手段”等方面取得了重大突破，找到了新的治疗方案：一是将用药时间适当延长，由原来的三天疗法增至五天或七天疗法；二是更换已产生抗药性的辅助药物，疗效显著。