安徽大学数学科学学院在学科建设方面取得了显著成就。学院拥有数学和统计学两个一级学科博士授权点，其中基础数学与概率统计是安徽省首批重点学科，并连续入选第二批（2002年）和第三批（2008年）省级重点学科，还被列为国家“211”工程重点建设学科。学院还设有“基础数学”皖江学者特聘教授岗位和“应用数学”皖江学者讲席教授岗位，以及省“基础数学”博士后流动站岗位，这些都为教师和学生提供了更多的发展机会。相比之下，西南大学数学与统计学院虽然也有“基础数学”博士学位授权点，但其数学专业仅作为硕士学位授权一级学科。尽管西南大学在多个研究方向招收博士研究生，但其博士点数量较少，博士生导师数量也相对较少。