德国牧羊犬具有多种颜色，如黑色、棕色、红棕色、金黄色和浅灰色等。毛发分为表层体毛和下层体毛，表层体毛浓密直硬，下层体毛浅灰色。头部、耳部、爪部和腿部的毛发长而浓密，后腿的毛可以形成类似“裤子”的富毛区。雄性犬的重量在30到40公斤，雌性犬在22到32公斤之间。睾丸必须在阴囊中发育完好。德国牧羊犬有多种缺陷，包括耳朵位置过低、耳朵柔软、耳尖翻卷等。绝对不可用于繁殖的缺陷包括脆弱的个性和过分的神经质、严重的髋关节病症、尾巴和耳朵畸形、犬有残损、犬牙不全、犬爪有残缺、超过或低于德国牧羊犬正常身高标准1厘米、白化病、头部毛发是白色的（鼻部和眼部的毛发仍为黑色的除外）、中长毛犬和长毛犬等。