岛中的察拉塔纳纳山是马达加斯加最高的山峰，海拔2876米。东部地区多为沙丘和泻湖，而西部则是缓倾斜的平原，从500米的高原逐渐过渡到沿海的平坦地带。马达加斯加有四条较大的河流，包括贝齐布卡、齐里比希纳、曼古基和曼古鲁河。气候方面，东南沿海地区属于热带雨林气候，全年温暖湿润，季节变化不明显。热带高原气候在中部地区占主导，气候温和凉爽。西部地区则属于热带草原气候，干旱少雨。自然资源方面，马达加斯加储备丰富。其石墨储量在非洲居首位，此外还有云母、铀、铅、宝石、石英、金、银、铜、镍、铝矾土、铬和煤等矿产资源。由于河流湍急，水力发电的潜力巨大。森林覆盖面积达到1470万公顷。