长期低烧还可能是病毒感染的结果，尤其是在婴幼儿中更为常见，通常表现为咽喉部感染，无全身症状。这类儿童一般检查结果无明显异常，无呼吸道症状。有时，咽部链球菌或金黄色葡萄球菌感染也可能导致长期低烧，可通过咽部分泌物培养进行诊断，同时检查抗链球菌溶血素O（抗“O”）滴定度，以判断是否为链球菌感染。女孩长期低烧时，应注意是否存在泌尿系感染，可通过尿液检查来确认。长期低烧也可能与血液疾病相关，如白血病、再生障碍性贫血、溶血性贫血等。如果有贫血、出血或黄疸等症状，建议进行血液检查以确定是否与此相关。慢性肝炎患者也可能出现长期低烧。