1.违法建筑：未经批准或违反规划私自建造的房屋，无法获得合法证书。2.占用耕地：违反国家耕地保护政策，占用耕地建造的房屋，无法办理证书。3.无产权证明：房屋没有合法的土地使用权和房屋所有权证明，无法办理证书。4.权属不清：房屋存在产权纠纷，权属关系不明确，无法办理证书。5.未完成审批手续：房屋建设未完成相关审批手续，如规划许可、建设许可等，无法办理证书。这些房屋由于不符合国家法律法规和政策要求，无法获得合法的房屋证书。