游戏开始时，玩家可以选择性别角色，共同的目标是成为口袋妖怪联盟的冠军。玩家将通过冒险和挑战，收集并培养自己的口袋妖怪，使其成为最强的战士。值得一提的是，新作中加入了新的口袋妖怪，同时考虑了现有口袋妖怪的新进化形态。《口袋妖怪钻石》和《珍珠》预计于2006年8月25日发售，其特点包括利用NDS的Wi-Fi功能实现最多16人同时游戏，以及触摸屏在游戏系统中的重要作用。游戏中的新大陆设定，以及与GBA和NGC版《口袋妖怪》通信，让玩家可以将之前的口袋妖怪传输到NDS版中。在《口袋妖怪钻石》中，新的“口袋妖怪图鉴”和“ナナカマド博士”增加了许多新功能，如听口袋妖怪的叫声和比较妖怪们的身高体重。使用“怪兽球”捕捉野生口袋妖怪时，口袋妖怪的HP越少、睡眠或麻痹状态时，就越容易捕捉。