在使用过程中，需注意可能出现的副作用，包括但不限于胃肠道反应如恶心、呕吐、腹泻，过敏反应如皮疹、瘙痒，以及罕见的严重反应如多形性红斑和Steven-Johnson综合征。药物的蛋白结合率高，主要通过胆汁和尿液排泄。尽管盐酸克林霉素在体内的分布广泛，但因其不能透过血脑脊液屏障，故不适用于脑膜炎的治疗。对于孕妇和哺乳期妇女，使用时需谨慎，因为药物可能透过胎盘或分泌至母乳中。儿童使用时，应特别注意其剂量和用药时间，出生4周以内的婴儿禁用。老年人使用时，更需密切观察，因他们可能更容易出现不良反应。与其他药物合用时，需注意药物间的相互作用，如与抗胆碱酯酶药物或钙盐合用，可能增强神经肌肉阻断作用；与抗蠕动止泻药合用，可能增加腹泻风险；与抗肌无力药合用时，可能减弱后者的效果。