白芨的采收一般在种植后的第四年，即10月，当茎叶黄枯时进行。这时地下块茎已长成8至12个，较为拥挤，过晚采收会影响生长。采挖时先清除地上残茎枯叶，然后用二齿耙小心挖取块茎，抖去泥土，运回加工。加工时，将块茎单个摘下，不去须根，先选取有老杆的块茎作为种栽。然后剪去茎杆，放入箩筐内，置清水中浸泡1小时后，用足踩去粗皮，洗净泥土，投入沸水中煮5至10分钟，直至块茎内无白心，捞出晒干。如遇阴雨天，可将白芨置于火炕上烘干，大约5至6小时后，待表皮干硬，再用硫黄熏蒸12小时，每100公斤鲜块茎用硫黄0.2公斤，熏透心后取出炕至全干。通过硫黄熏蒸，白芨不易霉变、虫蛀，且色泽洁白透明。