目前，已报道的几千种抗生素可以大致分为六个类型。第一类为糖的衍生物，这类抗生素主要由氨基己糖的衍生物组成，例如链霉素。第二类为多肽类抗生素，主要或全部由氨基酸组成，具有多肽或蛋白质的某些特性，如多粘菌素、青霉素。第三类为多烯类抗生素，这类抗生素的分子结构中有多个双键，比如制霉菌素、两性霉素。第四类为大环内酯抗生素，这类抗生素由一个或多个单糖组成并与碳链一起形成一个巨大的芳香内酯化合物，例如红霉素。第五类为四环类抗生素，这类抗生素都具有四个缩合苯环，如四环素。第六类为嘌呤类抗生素，这类抗生素都含有嘌呤环，例如嘌呤霉素。