另外，捕捉克隆精灵（70级超梦）需要先在狩猎区域与一男子对话获得精灵笛子，然后前往幻象三层解决挡路的卡比兽，从卡比兽身下的通路前往深处捕捉。在开拓区右下角的山洞中，可以捕捉到超梦（60级）和迪奥西斯（50级）。同时，月映兽（钢+超能）在日落山上有雾的草坪出现几率较大，而石牙子（超能）则较常见，同样在日落山上有雾的草坪。梦幻船票可以捕捉30级红蓝水都，需要通关后乘船到边疆挑战区域，下船后与岸边的水手对话获得，之后从阿田市乘船到南方小岛。此外，三圣鸟包括捕捉50级急冻鸟、50级闪电鸟、50级火焰鸟。三圣兽则需要捕捉50级炎帝、50级雷皇、50级水君。三神柱包括捕捉40级岩神柱、40级冰神柱、40级钢神柱。这些都是在通关后的特定地点捕捉。