1.南京：1368年，朱元璋称帝，建立明朝，将应天（即南京）定为京师。南京作为首都，承担着明朝的政治中心职能。2.中都凤阳：朱元璋在 initially 将南京定为京师后，于1369年决定将凤阳作为中都，开始建造宫殿。但这一决定在1375年被朱元璋自己所放弃。3.北京：1402年，朱棣占领南京后，于次年将北平改名为北京，并开始准备迁都工作。明成祖永乐十九年（1421年），明朝正式迁都北京，南京应天府则被定为留都，继续保留一定程度的首都地位和中央机构。因此，明朝时期的&quot；京都&quot；最终确定为北京，而南京则作为留都，继续保持一定程度的首都功能。这样的决定是出于政治和经济的双重考虑，一方面为了加强北方对南方的管理，另一方面则是将南京作为南方经济中心。