对自营出口业务、产品附加值较低的传统商品及产品销往欠发达地区的企业来说，退税率下调的影响更为显著。这些企业规模较小，利润本来就低，有些还依靠出口退税维持运营。退税率下调后，产品成本上升，竞争力下降，可能导致部分企业转产或倒闭，进而造成新的失业和下岗问题，给社会带来负担。同时，出口企业上游供应商和下游销售环节的利润也会受到影响，具体影响程度取决于企业在货物供应流转中的地位。企业在提价问题上面临两难选择。一方面，部分企业正在考虑提高成交价格，以抵消出口退税下调的影响。但另一方面，这样做可能导致失去订单和市场份额，使得企业左右为难。