2.即便员工选择自动离职，由于他们曾为公司工作，公司仍需支付他们工资。公司可以在合理的规章制度下对员工的工资进行适当的扣除，但这一做法必须建立在合法合规的基础上。例如，公司的规章制度需要经过民主程序讨论，并获得大多数员工的认可，并且对员工进行了培训并让他们签名确认，或者这一条款已明确写入劳动合同中。法律依据。- 《中华人民共和国劳动法》第四十八条：国家实行最低工资保障制度。最低工资标准由省、自治区、直辖市人民政府规定，并报国务院备案。用人单位支付给劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条：用人单位应当按照劳动合同的约定和国家规定，及时足额支付劳动者的工资。若用人单位拖欠或未足额支付工资，劳动者可以向当地人民法院申请支付令，法院应依法发出支付令。