鸡的呼吸系统疾病同样需要关注，如喉气管支气管炎和马立克病。前者可以通过疫苗和百病金刚或替氟奇星加痰咳清进行预防，治疗时则使用红氟、呼速康和病毒灵。马立克病的预防主要依赖于出壳后的疫苗注射，一旦患病则只能淘汰鸡只。鸡瘟可以通过疫苗注射来预防，治疗时则需要三倍量注射疫苗、扶正散和呼毒通治。此外，大肠杆菌病及肠毒综合症的预防和治疗也很关键，可以使用肠毒特效或肠速安或瘟毒克进行预防，治疗时则需要红氟、瘟毒克和强力杆菌灭。