1、单位性质不同。行政编是国家机关，事业编是社会服务组织。2、任务不同。行政编负责国家事务的组织、管理、指挥，事业编是社会公益性的科、教、文、卫的专业服务提供者。3、编制不同。行政编使用行政编制，事业编使用事业编制。4、经费来源有所不同。行政编完全财政拨款，事业编多为财政拨款，也可以自筹一部分，如医院。5、工作人员工资待遇有所不同。行政编多为公务员工资待遇，也有少量行政工人工资，事业编以专业技术人员工资待遇为主，辅以管理人员、工勤人员工资。