影响。个税退税确实会导致摇号资格审核不通过。核对已缴税款时，要求“实缴（退）金额”显示的税额需大于零。如果出现退税金额大于个人缴纳的税款金额，就会对摇号资格产生影响，导致审核不通过。北京市交通委规定：非北京户籍人员参与购车摇号，需要连续五年(含)以上在北京市缴纳社会保险和个人所得税，其中，“近五年（含）连续在本市缴纳个人所得税”指的是：申请人从申请年的上一年开始往前推算连续五年，每年在京缴纳个人所得税，且纳税额大于零，可以断月，不能断年；如有断年，补缴无效，如不符合上述规定，则无法继续参与本市小客车配置指标申请。