1、种植技术不同：非转基因大豆是经过自然播种、种植生长出来的，属于纯天然产物，整个过程中没有经过任何人工干预，来改变大豆的特性。转基因大豆，则是使用了现代生物种植技术，在大豆中转入了抗虫、抗药等基因，来获得表达相应基因的品种。2、外观形态不同：转基因大豆的外观形状较规则，多为正圆形，因为成熟较快的原因，颜色较均匀，多为淡黄色，个头要更大一些，豆脐部位不太明显，外观较整洁，少有虫蛀现象。和转基因大豆相比，非转基因大豆形状多为椭圆形，颜色也要更深。3、营养价值不同：非转基因大豆属于营养价值很高的豆类食材，当中含有丰富的蛋白质、钙、维生素和矿物质，也是蛋白质含量最多的粮类食材。转基因大豆有经过外源基因的转入，这些外源基因对大豆中含有的营养成分的破坏程度。