战争破坏：明代末期，中国发生了多次战乱，许多古建筑遭到了严重的损毁，其中一些装饰着龙纹琉璃的建筑也不幸被毁。例如，北京的大报恩寺琉璃宝塔，在清兵入关时被焚毁，只留下了一些琉璃砖构件。盗窃贩卖：明代的龙纹琉璃由于其精美的工艺和富丽的色彩，深受收藏者和艺术家的喜爱，因此也成为了盗墓者和贩子们觊觎的对象。许多龙纹琉璃被从原来的建筑上剥离下来，然后被非法出售或者流入海外。例如，大英博物馆收藏了一组20块龙纹琉璃砖，这些琉璃砖原本是山西寺庙屋脊上的装饰品，但在20世纪早期被从原址移走，并经过多次拍卖后送到了大英博物馆。