1、国家标准不同：低保户是指因残疾或疾病符合国家标准，住房或收入低于市低保标准的居（村）民，享受国家最低生活保障补助的家庭，建档立卡贫困户是对每个贫困户建档立卡，建设全国扶贫信息网络系统。2、评定标准不同：因为地区发展不平衡，所以每个省市的低保标准也有很大差异，主要有无经济来源、无劳动能力、无法定赡养人或抚养人的居（村）民，领取失业救济金期间或失业救济期满仍未能重新就业，家庭人均月收入低于市低保标准的居（村）民；各省（自治区、直辖市）在已有工作基础上，坚持扶贫开发和农村最低生活保障制度有效衔接，按照县为单位、规模控制、分级负责、精准识别、动态管理的原则，对每个贫困户建档立卡，建设全国扶贫信息网络系统。