1、确认系统版本：银河麒麟有多个版本，不同版本的系统设置可能不兼容。如果不确定如何操作，可以参考相关的文档或者向专业人士咨询。2、安装Cygwin：在银河麒麟系统中运行WindowsEXE文件需要先安装Cygwin环境。可以通过终端输入命令`sudoapt-getinstallepel-release`，然后`sudoyuminstallcygwin`来安装Cygwin。3、运行EXE文件：安装Cygwin后，可以使用`start/min文件名.exe`命令在银河麒麟系统中运行WindowsEXE文件。