农村合作医疗保险与社保的区别如下：1、农村合作医疗保险只能农民，也就是拥有农村户口的人才可以参加。2、农村合作医疗保险必须以家庭为单位整户参加。3、农村合作医疗保险是一年一交费，一年一参合，参合本年度享受报销。4、因农村合作医疗保险基金筹措有限，保障力度略低。5、农村合作医疗保险为国家的政策，以解决参合农民“因病致贫、因病返贫”为最终目的。社保中的医疗保险具有“低水平，广覆盖”的特点，缴费以低水平的绝大多数单位和个人能承受的费用为准，广泛覆盖城镇所有单位和职工，不同性质单位的职工都能享有基本医疗保险的权利，参保人员完成缴费年限后可以终身享受。其次基本医疗保险具有“双方负担，统账结合”的特点，根据以收定支，收支平衡的原则，按统一标准享受待遇。