纳税人办理纳税申报的流程有：1、到主管税务机关办理纳税申报，如实填写纳税申报表；2、提交纳税申报资料，包括财务会计报表及其说明材料，税控装置的电子报税资料等主管税务机关规定的必报资料。法律依据。《中华人民共和国税收征收管理法》。第一条 为了加强税收征收管理，规范税收征收和缴纳行为，保障国家税收收入，保护纳税人的合法权益，促进经济和社会发展，制定本法。第二条 凡依法由税务机关征收的各种税收的征收管理，均适用本法。第三条 税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行律授权国务院规定的，依照国务院制定的行政法规的规定执行。任何机关、单位和个人不得违反法律、行政法规的规定，擅自作出税收开征、停征以及减税、免税、退税、补税和其他同税收法律、行政法规相抵触的决定。