1、二者行政级别有区别。派出所所长应该是乡科级副职或股级正职干部；县区公安局局长是乡科级正职领导干部。2、二者权限有区别。主要是。（1）公安派出所是公安局的派出机构，派出所要服从所在公安局的领导，当然派出所所长要接受公安局局长的领导。（2）派出所一般不能以自己的名义对行为人进行处罚（少数治安案件除外），但公安局可以以自己的名义独立办理治安案件和刑事案件，可以依法对行为人做出处理。也就是说，公安局长的职责与权限，比派出所长要大的多。3、二者岗位职责有区别。派出所所长负责主持派出所的全面工作。法律依据。《中华人民共和国人民警察条例》。第七条 中华人民共和国公民身体健康、具备一定的文化程度、自愿充任人民警察的，经县、市以上公安机关审查合格后，可以充任人民警察，但是被剥夺政治权利的人除外。