1、设立的法律基础不同：合伙企业以全体合伙人意思表示一致的合伙协议为法律基础，对合伙协议的订立者有约束力；而公司是以公司章程为基础。2、法律地位不同：合伙企业不具有法人资格，合伙企业的财产一般为全体合伙人共有；而公司有独立的法人资格，有区别于股东财产的公司财产。3、运营方式不同：合伙企业合伙事务的执行一般可以按照合伙协议或者经全体合伙人决定，可以委托一个或者数个合伙人对外代表合伙企业执行合伙事务。而公司中有比较健全的管理机构，对外一般由公司的法定代表人代表公司进行处理。