1、机构性质不同：上海教卫工作是上海的派出机构，负责管理本市教育、医疗卫生等公共事业领域党的工作，而上海市卫生健康委员会则是市组成部门，负责全市卫生健康工作的管理和监督。2、职责定位不同：上海教卫工作的主要职责包括贯彻执行党的教育方针和国家有关教育的法律、法规和规章，研究制定本市教育改革与发展战略、措施等，而上海市卫生健康委员会则主要负责全市卫生健康工作的规划、协调和管理，包括制定卫生健康、推进医疗改革、实施疾病预防控制、开展健康教育等。