根据《中国共产党发展党员工作细则》，预备党员的预备期为一年。如果预备党员在预备期表现良好，可以按照程序进行转正。然而，如果预备党员超过了预备期，可能会取消其预备党员的资格。具体来说，根据《中国共产党发展党员工作细则》第三十二条规定，预备党员的预备期为一年，同时可以延长一次预备期，但延长时间不能少于半年，最长不超过一年。如果预备党员在延长预备期后仍未能转正，那么将会取消其预备党员的资格。因此，如果预备党员超过了预备期三年，其转正申请可能不会被承认。在考虑是否转正时，党组织会综合考虑预备党员的表现、党龄、工作经历等多个因素来做出决定。