房贷扣款日当天存入的不算逾期。用户在房贷扣款当天存钱，钱在系统扣款前到账，系统就可以正常进行扣款，这样是不算逾期的。而系统先扣款，之后用户才存钱到账，要等系统当天第二次扣款，第二次扣款成功也不算逾期。最差的情况是，房贷扣款当天存钱，系统扣款失败，那么就会算逾期。