1、存在安全隐患：一卡通系统要求用户输入个人信息和密码，如果系统安全性不足，会导致用户信息泄漏和资金被盗的风险。2、充值方式单一：目前一卡通只能通过柜台或网上银行充值，不能像支付宝或微信支付那样通过手机应用充值，不够方便。3、适用范围有限：一卡通主要用于学校、医院、公交等特定场所，不能在其他场所或商户使用，不够通用。4、服务质量不稳定：由于一卡通系统需要与各种机构和服务提供商合作，服务质量可能存在不稳定性，如出现系统故障或人工服务不到位等问题。