结论是，如果房贷自动扣款时余额不足，当天存款后银行会进行第二次扣款，但这并不意味着贷款余期减少。这种情况下，虽然系统会尝试补扣，但仍然算作逾期还款，因为未能在还款日当天全额还款。银行系统在还款日当天会进行多次扣款，一旦首次扣款未成功，后续补款也会被视为逾期，可能影响信用记录。因此，为了避免逾期，建议贷款人在还款日前一两天就将全额金额存入银行卡，确保系统在规定时间内能够成功扣款。值得注意的是，不同银行的扣款时间可能不同，通常在扣款日当天的0点至23点59分之间，所以确保还款时间准确至关重要。另外，初次申请房贷时，用户需按要求填写个人信息，如姓名、证件信息等。