昌吉位于中国的西北部，确切地说，它隶属于维吾尔自治区。这个自治区的北部边缘地带，昌吉回族自治州坐落在天山的北麓和准噶尔盆地的东南缘，地理坐标为北纬43°20′～45°00′，东经85°17′～91°32′。它东边与哈密市接壤，西边与石河子市相邻，南边与吐鲁番市和巴音郭楞蒙古自治州为邻，北部则与塔城和阿勒泰地区相接，东北部与蒙古国交界，形成了一种独特的地理位置，环绕着乌鲁木齐市。昌吉州行政区划包括五个县（玛纳斯县、呼图壁县、吉木萨尔县、奇台县和木垒哈萨克自治县），两个城市（昌吉市和阜康市），以及三个重要的经济园区（准东经济技术开发区、昌吉高新技术产业开发区和昌吉国家农业科技园区）。州内的地形多样，从南部的天山山地，中部的冲积平原，到北部的沙漠盆地，形成了鲜明的地理层次。