在工作时间相同且月工资相同的条件下，员工的住房公积金总额差异主要源于缴存比例的不一致。住房公积金的计算基于职工上一年度的月平均工资，乘以个人和单位各自的缴存比例。例如，甲员工公积金缴存1800元，乙员工缴存2000元，这反映出他们各自的缴存比例可能不同。住房公积金和社保虽然都是为员工福利，但计算基数不同。住房公积金的基数取决于员工的工资，而社保的基数可能受到其他因素的影响，如最低工资标准或调整。单位为员工缴纳的公积金金额同样受缴存比例影响，而社保缴纳比例可能会随着社保支出压力增大而有所变动。根据《住房公积金管理条例》的规定，新入职员工应在30日内办理公积金缴存登记，而离职员工则需在劳动关系终止后30日内进行变更登记。月缴存额的具体计算公式是职工上一年度月平均工资乘以各自的缴存比例。