企业清算时存货和已抵扣进项税金的固定资产发生非正常损失。企业清算时应先进行资产评估、清查，对存货和已抵扣进项税金的固定资产发生非正常损失的，应作进项税额转出处理，企业清算时仍有存货和已抵扣进项税金的固定资产。企业清算时，全部资产均应按可变现价值或交易价格，确认资产转让所得或损失。二、分析；根据相关法律规定，一般纳税人注销或被取消辅导期一般纳税人资格，转为小规模纳税人时，其存货不作进项税额转出处理，其留抵税额也不予以退税。公司注销时留抵的增值税进项税额不予以退税。企业发生的除企业所得税和允许抵扣的增值税以外的各项税金及其附加，准予在计算应纳税所得额时扣除。虽然一般纳税人注销时留抵的增值税进项税额不予以退税，但在计算应纳税所得额时是准予扣除的。三、什么是留底税。