北京协和医学院和清华大学北京协和医学院并非同一所学校，而是紧密合作的关系。协和医学院拥有的本科基础课程体系，在专业课程上则由协和负责，学生的毕业证书上同时盖有清华大学和北京协和医学院的章。虽然协和医学院并非985、211高校，但由于与清华大学的紧密合作，其毕业生在社会上通常被视为享有985高校的声誉。在医学领域，北京协和医学院的声誉可能超过一些顶级大学的医学院，反映出其专业的优势。清华大学医学院则是清华大学设立的一个学院，目前发展相对较弱。当初，清华大学曾试图与协和医学院合并，但未能实现，于是双方选择了合作办学。从资源共享和品牌影响力来看，北京协和医学院—清华大学医学部无疑更受认可。