公司内部的两个部门确实可以单独设置账套进行内部核算，这样每个部门都能有的财务记录。然而，如果这些账套也用于对外报告，可能会遇到问题，因为这样会导致会计报表的重复，需要额外的手工处理来合并数据。一个更灵活的方法是利用软件的明细科目功能。比如，可以设定“管理费用”下的“办公费”再进一步细分为“A部门打印费”和“B部门打印费”。这样，即使使用同一套账套，通过清晰的科目分类，也能准确地追踪每个部门的开支。如果公司使用统一的财务软件，各部门在使用时只需注明所属部门，这样在月底结算时，系统会自动区分部门，无需额外设立多个账套。公司的基本存款账户是以法人名义开设，作为企业的主要资金管理工具。