股权转让过程中，资金的流动路径与一般的理解有所不同。股权转让时，资金的支付方向通常是受让方直接转账到转让方的账户，而非目标公司账户。这是根据合同法基本原则，如第八十规定，债务人有权将合同权益转移给第三人，但需经债权人同意。在实际操作中，税务部门有时会要求提供股权转让款的支付证明，但这并不构成法律强制，如未到约定支付时间，可以合法地拒绝提供，并可能通过行政诉讼解决。如果税务部门或工商部门要求将款项支付到目标公司，应要求其提供明确的执法依据，因为这可能违反了资金流向的基本规定，只有在目标公司注册资本增加，股东注入资本的情况下，才会将款项支付到公司账户。