全国医师定期考核分为简易程序和一般程序，两种程序在流程和业务水平测评标准上有所不同。首先，简易程序流程相对简化，主要由医师本人撰写述职报告，经主要执业结构签署意见后直接上报考核机构进行审核。而一般程序则需要医师登录系统填写详细信息，由医疗机构进行工作成绩和职业道德评定，然后上报给考核机构。考核机构会复核意见、公布测评名单，进行业务水平测评，最终在系统中录入结果。合格者会收到电子通知，还需经卫生计生行政部门盖章后生效；不合格者可能面临暂停执业活动的处罚，之后有培训再考的机会。