宅基地纠纷主要分为两类：一类是因权属不明引起的案件，另一类是因侵权或随意处分宅基地引起的民事案件。宅基地纠纷通常与房屋纠纷、相邻权纠纷、婚姻、继承纠纷及分家析产纠纷相伴生。二、农村宅基地纠纷立案时应注意的问题。1.审查原告资格：原告应与争议宅基地有直接利害关系，或因他人侵权行为而要求法院保护其合法权益。原告提起侵权之诉时需提交宅基地使用证。2.审查被告资格：(1)被告与原告权利有直接法律利害关系，如占有争议宅基地的人；(2)妨碍原告合法使用宅基地的人，如越界建房的人或阻止施工的侵权人。3.确定法院主管权：首先，判断是否为行政案件；其次，审查是否有其他不属于法院管辖的情况，例如单位将土地提供给职工建私房所引起的纠纷。